课题组介绍
课题组简介
潘玮华课题组依托中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所，主要从事基因组学相关的生物信息学算法研究。
我们将前沿的基因组学技术（PacBio HiFi、Oxford Nanopore、Hi-C、BioNano、10x Genomics 等）与先进的计算技术（组合优化算法、图论、概率统计、人工智能等）相结合，开发新颖、准确、高效的算法，用于攻克本领域尚未解决或尚未完全解决的难题，并将开发的算法技术应用于科研项目，辅助解决重大科研问题。
课题组长
潘玮华，研究员，博士生导师。2019 年获美国加州大学河滨分校博士学位，2019—2020 年在美国卡内基梅隆大学从事博士后研究（Lane Fellow）。
长期从事基因组序列分析相关的算法开发与应用研究，近五年主要成果以最后通讯作者发表在 Nature Genetics、Genome Biology、Genome Research、Advanced Science 等期刊。主持国家自然科学基金面上项目、青年科学基金（C 类）、中国农科院青年创新专项项目（150 万）等。
担任 ISCB-China 理事、中国生物信息学学会（筹）基因组信息学专委会和生物信息算法专委会委员、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员等。
联系方式
- 潘玮华：panweihua@caas.cn（科研合作、招生咨询）
- 张纤纤：zhangqianqian@caas.cn（行政事务）
我们在做什么
研究方向
本团队主要从事基因组学相关的生物信息学算法研究，目前尤其关注基因组组装、序列比对、图泛基因组、基因组大语言模型等关键性计算问题和计算模型。
近期工作
代表性成果
近五年主要成果以最后通讯作者发表在 Nature Genetics、Genome Biology、Genome Research、Advanced Science 等期刊。
Pangenomic analyses of rose uncover widespread structure variation and empower genomics-directed breeding
X. Zhang, L. Lan, Y. Yang, H. Guan, D. Peng, H. Jiang, Q. Wu, R. Huang, X. Liao, S. Lin, D. Gong, B. Huang, C. Bellot, J. Szécsi, M. Bao, M. Bendahmane, X. Fu, Z. Wu, W. Pan
Nature Genetics · 2026
Time-Efficient and Informatic-Skill-Light Gap-Filling for Telomere-to-Telomere Genome Assembly
D. Xu, X. Zhao, L. Shang, S. Tian, Y. Li, H. Wen, Q. Xu, D. Li, W. Pan
Advanced Science · 2026
Reference-Guided Chromosome-by-Chromosome de novo Assembly at Scale Using Low-Coverage High-Fidelity Long-Reads with HiFiCCL
Z. Jiang, W. Pan, R. Gao, R. Hu, W. Gao, M. Zhou, Y. Yin, Z. Qian, S. Jin, G. Wang
Advanced Science · 2026
TRFill: synergistic use of HiFi and Hi-C sequencing enables accurate assembly of tandem repeats for population-level analysis
H. Wen, R. Yang, X. Zhao, X. Wang, J. Lei, Y. Li, W. Du, D. Li, Y. Xu, S. Lonardi, W. Pan
Genome Biology · 2025
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招聘
课题组长期招聘博士后，同时欢迎博士研究生、硕士研究生联系报考，也欢迎本科生参与科研训练与毕业设计。
我们期待你
- 具备扎实的数学与编程基础（熟练掌握 Python 或 C++ 至少一种）
- 熟悉 Linux 开发环境，能独立复现与改进已有算法
- 能顺畅阅读英文文献，并撰写清晰的实验报告
- 对基因组学或算法研究有真实的好奇心，而不只是为了一纸文凭
申请方式
请将 个人简历 + 成绩单 + 一段简短的自我介绍 发送至 panweihua@caas.cn，邮件标题注明「应聘 - 博士后/博士/硕士 - 姓名 - 毕业院校」。我们会在一周内回复。